基于WGCNA方法挖掘茶树响应草铵膦的关键转录因子

草铵膦是一种非选择性除草剂,在应用于茶园杂草防控时可能会对茶树造成危害,影响茶树生长.为挖掘茶树响应草铵膦的关键转录因子,选取草铵膦处理茶树5个时期的转录组数据,并通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法构建模块.411个转录因子构建的WGCNA网络被划分为5个模块,其中Green模块和Blue模块具有时期特异性(r＞0.95且P＜0.05).Green模块中转录因子的表达水平皆在草铵膦处理茶树0.5 d时最高,相对于CK(草铵膦处理0 d)的差异倍数为1.51-1 202.84;而Blue模块中所有转录因子的表达水平在草铵膦处理茶树后皆显著下调.采用Cytoscape对Green模块和Blue模块中的转录因子绘制基因互作网络图,进而根据高连通性筛选出10个关键转录因子,包括1个WRKY、2个C2H2、3个MYB、2个GRAS、1个LOB和1个BES1.综上,WGCNA方法筛选出了2个具有生物学意义的模块,进一步挖掘得到的10个关键转录因子与草铵膦处理后茶树的油菜素内酯信号转导调控、逆境响应和碳氮代谢密切相关;结果可为进一步探究茶树响应草铵膦的分子机制奠定基础.