基于网络药理学与体外实验研究清髓消炎汤治疗骨髓炎的作用机制

Journal of Yunnan University of Nationalities(Natural Sciences Edition)(2023)

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摘要
通过TCMSP和 BATMAN-TCM数据库筛选经验方中的中药化合物及作用靶点;通过GeneCards、DRUGBANK、TTD数据库查找骨髓炎疾病相关靶点,取疾病与中药化合物靶点的交集靶点预测清髓消炎汤治疗骨髓炎的潜在靶点.运用 Cytoscape 软件构建分析"中药-成分-成分作用靶点-疾病靶点"网络图;利用 STRING 数据库平台分析作用靶点 PPI 网络;通过DAVID、微生信数据库对作用靶点进行GO功能和KEGG通路的富集分析.利用 AutoDockTools及PY-MOL软件对清髓消炎汤中核心靶点与疾病的核心靶点进行分子对接与体外实验验证清髓消炎汤对骨髓炎常见耐药菌MRSA的抑制,探索清髓消炎汤治疗骨髓炎的作用机制.筛选得到清髓消炎汤中289 个成分靶点,骨髓炎有944 疾病靶点,得到交集靶点83 个.通过网络拓扑学分析得到主要有效成分quercetin、luteolin、fisetin、kaempferol、baicalein、naringenin,主要作用靶点TNF、IL-6、IL-10、STAT3、IL-1 β、MAPK14 等.主要成分与靶点分子对接结果均为负数,均有很好的自由结合能力.清髓消炎汤(Qingsui Xiaoyan Decoction,QSXYD)对MRSA 的MIC 和MBC 分别是31.3 和62.5 mg/mL;QSXYD影响MRSA生物被膜(MRSA-BF)内的活菌量和生物被膜的代谢活性,并呈现剂量依赖(P<0.05);SEM显示QSXYD影响细菌的个体大小、结构疏密程度、菌体表面的形态;RT-PCR结果显示sub-MIC浓度的QSXYD可明显抑制MRSA相关毒力基因与生物膜形成相关基因的表达(P<0.05).通过网络药理学和体外实验等方法研究结果显示,清髓消炎汤可以通过多靶点、多通路作用于治疗和预防骨髓炎,为清髓消炎汤临床应用于治疗骨髓炎提供理论依据.
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