人主动脉平滑肌细胞表型转化的ceRNA网络研究

目的 基于全转录组测序数据,构建人主动脉平滑肌细胞(human aortic smooth muscle cells,HASMCs)表型转化模型的竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)调控网络,筛选HASMCs表型转化的关键ceRNA调控轴.方法 使用血小板源性生长因子-BB(platelet derived growth factor-BB,PDGF-BB)处理构建HASMCs表型转化模型.定量聚合酶链式反应(quantitative polymerase chain reaction,qPCR)验证模型构建成功后进行全转录组测序,筛选出差异表达的信使 RNA(messenger RNAs,mRNAs)、微小 RNA(microRNAs,miRNAs)以及长链非编码 RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs).对差异表达mRNAs进行基因功能分析和信号通路注释,通过生信分析及数据库预测,构建基于lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络.结果 HASMCs表型转化模型全转录组测序共筛选出326个差异表达的lncRNAs、34个差异表达的miRNAs、1 785个差异表达的mRNAs.差异表达的mRNA涉及TGF-β信号通路、Ras信号通路.ceRNA网络包含4个lncRNA节点、4个miRNA节点和83个mRNA节点,其中由NONHSAT253669.1介导的ceRNA调控轴在HASMCs的表型转化中可能发挥重要调控作用.结论 成功绘制HASMCs表型转化的ceRNA网络,筛选关键ceRNA调控轴,有望为HASMCs表型转化异常所致心血管疾病的防治提供新的线索和策略.