基于网络药理学与分子对接技术探讨白花蛇舌草治疗骨肉瘤的信号通路及分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究白花蛇舌草治疗骨肉瘤的作用机制.方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药综合数据库(TCMID)平台,检索白花蛇舌草化学成分和作用靶点,并通过基因卡(GeneCards)、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)和疾病靶点预测数据库(TTD)获取骨肉瘤相关靶点,预测白花蛇舌草治疗骨肉瘤的共同靶点,构建"中药-活性成分-靶点-疾病"网络图.通过STRING平台构建靶点蛋白互作网络(PPI),并使用R语言对PPI中的靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组(KEGG)信号通路富集分析.将相关度最高的前 5 位靶点和白花蛇舌草的活性成分进行分子对接,对结合能最大的活性成分-靶点构建对接模型.结果 共筛选出白花蛇舌草中 8 个活性成分,179 个对应的靶点.检索得到3596个骨肉瘤相关靶点,经R语言取交集得到 124 个共同靶点."中药-活性成分-靶点-疾病"网络提示,白花蛇舌草的 6 个活性成分作用于 124 个靶点基因以治疗骨肉瘤.PPI图中,124 个靶点相互作用关系密切,其中AKT1、TP53、IL-6、MAPK1、TNF等为核心靶点,与活性成分分子对接稳定,结合能最高的是槲皮素与MAPK1,结合能为-8.6 kcal/mol.GO分析显示,靶点涉及氧化应激反应、活性氧反应、DNA结合转录因子活性的调控、脂多糖反应、细菌源性分子反应、肌细胞增殖、类固醇反应等生物过程;KEGG信号通路包括IL-17 信号通路、TNF信号通路、前列腺癌、脂质与动脉粥样硬化、人巨细胞病毒感染、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体等信号通路.结论 白花蛇舌草的活性成分如槲皮素通过多靶点多途径治疗骨肉瘤.