网络药理学视角下杜仲抗骨质疏松的作用机制研究

Chinese Journal of Traditional Medical Traumatology & Orthopedics(2020)

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摘要
目的:基于网络药理学方法,根据杜仲活性化合物结构预测其作用靶点,与骨质疏松(OP)相关治疗靶点进行扩展后映射,拓扑出Hub节点并进行富集分析,揭示杜仲抗OP的物质基础及作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP),根据药代动力学特征筛选出杜仲的主要活性成分,并使用有机小分子生物活性数据库(PubChem)和Swiss Target Prediction数据库,根据化合物结构相似性预测出可能作用靶点,然后通过Drugbank搜集目前OP治疗药物及其相关靶点,结合预测靶点分别进行扩展后取交集,将所得重合靶点借助CytoNCA软件,根据相关节点参数拓扑出相互作用的关键节点,再导入String构建蛋白质相互作用网络图,最后通过DAVID数据库对关键节点进行生物功能及代谢通路分析.结果:筛选出15个杜仲活性成分,根据靶点预测技术预测出相关靶点196个;检索出OP相关靶点43个,经扩展-取交集-拓扑分析后共得152个Hub节点,根据String数据库构建蛋白相互作用网络,富集分析显示杜仲可能通过多条主流信号通路及细胞代谢全过程对OP产生调控作用.结论:杜仲可能通过直接或间接作用于靶点,参与调控上下游多条信号通路以干预OP的进展,为揭示其抗OP的机制及后续研究奠定了基础.
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