基于TCGA数据库的肝细胞癌铁死亡相关LncRNA风险预测模型的构建

目的 基于The Cancer Genome Atlas(TCGA)数据库建立肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)的铁死亡相关长链非编码RNA(LncRNA)风险预测模型.方法 通过TCGA数据库下载HCC基因表达谱数据和临床信息,获取LncRNA表达数据,从铁死亡基因数据库(FerrDb)下载的铁死亡基因和LncRNA进行共表达分析确定铁死亡相关LncRNA,通过单因素和多因素COX分析建立LncRNA预测模型,分析模型高、低风险组间生物学通路富集的差异和免疫相关功能差异.结果 共纳入22个LncRNA组成预测模型,该模型1年、3年和5年的生存预测性能AUC值分别为0.811、0.778和0.752,高风险组患者的总生存期(OS)明显低于低风险组(P<0.05).进一步分析表明免疫细胞及功能和免疫检查点在高、低风险组中存在差异.结论 22个LncRNA组成的风险预测模型可作为独立预测因子来有效预测HCC的预后.