基于SSR标记的东北杏遗传多样性分析及指纹图谱构建

Journal of Shenyang Agricultural University(2021)

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摘要
东北杏(Armeniaca mandshurica)是东北地区极具经济开发前景的树种,具有重要的生态、经济、社会价值,应用SSR分子标记技术,采用101对扩增条带清晰、多态性高的引物,对61份东北杏野生种质进行PCR扩增,以分析东北杏的遗传多样性,并采用引物组合法构建东北杏的SSR指纹图谱,旨在为东北杏种质资源的鉴定评价、保育研究及合理开发利用提供科学依据.结果表明:101个位点的平均观测等位基因(Na)和有效等位基因所占比值分别为9.6436和55.13%;平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.2155和0.7711;Shannon信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为1.7533和0.7316,表明东北杏种质资源具有丰富的遗传多样性.10个种源的遗传多样性差异显著,其中,辽宁省沈阳市的遗传多样性最高,而辽宁省丹东市的遗传多样性最低.聚类结果表明,在遗传相似系数0.842处可以将东北杏种质分为4类(A类、B类、C类、D类);在遗传距离0.250处可以将东北杏的不同种源分为3类(P1类、P2类、P3类),均反映了地理种源对东北杏的分类结果占据主导地位.地理距离与遗传距离呈显著相关(p<0.05),表明东北杏种质存在地理隔离现象.采用3对SSR引物(L46、P58H、L28H)构建了东北杏种质的SSR指纹图谱,为东北杏种质资源的分子鉴定提供了重要方法.
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