梭菌正丁醇代谢工程研究进展

正丁醇是大宗化学品和可再生、替代性车用燃料,可由微生物发酵生产,以替代现有的高污染/不可持续的石油炼制方法.本文首先回顾和比较了各种正丁醇合成途径和底盘细胞,指出梭菌是天然的正丁醇细胞工厂,且在丁醇产量和生产强度上有明显优势,但仍受制于菌株性能不足,具体表现在菌株遗传改造困难,正丁醇产量不高,副产物较多,正丁醇合成途径刚性强,以及底物利用效率低等方面.幸运的是,合成生物学的发展加速了产正丁醇梭菌的遗传操作工具开发.很多遗传操作工具如TargeTron、CRISPR/Cas系统介导的基因和碱基编辑工具已经被开发出来.梭菌内已经可以高效实现靶标基因插入、删除、替换、点突变以及表达水平调控等各种操作,这为梭菌正丁醇代谢工程奠定了良好的基础.正丁醇合成途径的增强及副产物如丙酮、乙酸、丁酸等竞争途径的弱化或者删除,提升了丁醇的产量、比例;同时,一些非常规梭菌被代谢工程改造用于同型丁醇发酵,实现丁醇与丙酮生产的解耦;另外,遗传操作工具还为梭菌的戊糖转运/代谢途径以及碳源代谢抑制效应的调控机制的解析和重构提供了便利,极大改善了梭菌戊糖利用效率.相信在合成生物技术的驱动下,梭菌生产正丁醇的成本将大幅降低,最终走向市场.