基于网络药理学、分子对接及分子动力学探讨秦艽-桑枝治疗类风湿关节炎的机制

目的 通过网络药理学及分子对接、分子动力学探讨秦艽-桑枝治疗类风湿关节炎(RA)的活性成分、作用靶点及作用机制.方法 通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索秦艽、桑枝的成分及作用靶点基因;将药对的作用靶点与GeneCards数据库检索所得的疾病靶基因取交集;根据交集结果进行GO功能富集和KEGG通路分析;通过Cytoscape得出核心基因;并选择PTGS2、CASP3、RELA等靶基因与秦艽、桑枝的活性成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷运用AutoDock Vina进行分子对接;通过Gromacs软件进行分子动力学模拟.结果 共筛选出秦艽-桑枝与RA共同靶基因90个.GO功能富集分析主要集中于对肿瘤坏死因子的反应、细胞调亡的调节、类固醇激素受体活性、肿瘤坏死因子受体超家族结合等.KEGG分析显示主要富集于TNF信号通路、调亡通路、IL-17信号通路、破骨细胞分化、类风湿关节炎等信号通路.分子对接及分子动力学结果显示药对的活性成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷能够与PTGS2、CASP3、RELA等靶基因紧密对接,形成稳定作用.结论 秦艽、桑枝的有效成分山奈酚、β-谷甾醇、龙胆苦苷可能通过作用于PTGS2、CASP3等靶基因,影响炎症因子释放及RA滑膜成纤维细胞的凋亡而发挥治疗RA的作用.