7株侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)基因组和毒力特征分析

Chinese Journal of Food Hygiene(2021)

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摘要
目的 探究侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的基因组和毒力特征.方法 针对收集的7株iNTS菌株开展全基因组测序,通过与相关数据库进行比对检索,对菌株的血清型和基因组信息以及毒力因子进行鉴定、注释和分析.结果 7株iNTS菌株中有6株单相菌,包括1株鼠伤寒血清型、2株Ⅰ4,[5],12∶i∶-(ST34型)、2株肠炎血清型、1株科瓦利斯血清型和1株未知血清型Ⅰ4,[5],12∶d∶-(ST279型).基因组组分未发现较一致规律,不同血清型菌株间差别大于同种血清型不同来源菌株.不同血清型沙门菌之间毒力因子分布差异较明显,尚未发现iNTS菌株共有的毒力因子分布特征,荚膜/免疫逃逸、毒素、周生鞭毛、肠菌素Salmochelin可能与菌株高侵袭性相关.所有测试菌株均含有Ⅲ型和VⅥ型分泌系统,且科瓦利斯沙门菌和Ⅰ4,[5],12∶d∶-沙门菌的Ⅲ型和VⅥ型分泌系统蛋白数量分别高于其他菌株.分泌系统效应蛋白SseI在部分沙门菌基因组中可能存在与侵袭性增强相关的假基因化.结论 暂未在毒力基因水平观察到与iNTS菌株高侵袭性相关的共性致病机制,仍需从功能转录组和蛋白质组层面进行进一步的分析和研究,以确定iNTS发生和传播的遗传基础.
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关键词
invasive non-typhoidal salmonella,serotype,virulence factor,genome
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