生信分析肾阴虚型绝经后骨质疏松症分子机制及熟地黄靶向治疗

Chinese Journal of Osteoporosis(2021)

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摘要
目的 基于生信数据挖掘探究肾阴虚型绝经后骨质疏松症的病理机制及熟地黄的治疗靶点.方法 通过GEO数据库挖掘阴虚型绝经后骨质疏松症患者差异表达基因,运用GeneCards及OMIM数据库预测骨质疏松症相关基因,采用R软件对阴虚靶点与骨质疏松靶点映射匹配.借助String数据库在线平台进行蛋白互作网络构建.分子对接预测熟地黄治疗阴虚型骨质疏松症的靶点.采用DAVID数据库进行生物过程及通路注释.结果 通过分析得到差异表达基因1272个,骨质疏松症靶点662个,阴虚型骨质疏松症相关靶点45个,主要涉及细胞凋亡调节、雌激素应答、骨骼肌系统发育等生物过程,并由PI3K-Akt、Wnt信号通路、MAPK信号通路、卵巢类固醇生成等信号通路调节.熟地2种有效成分能够作用于核心蛋白IGF1、VEGFA等.结论 熟地黄可能靶向IGF1、VEGFA等核心蛋白,通过PI3K-Akt、MAPK等信号通路调节细胞凋亡及雌激素应答过程,从而实现防治阴虚型骨质疏松症的疗效.
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