基于优化的卷积神经网络的蛋白质二级结构预测

蛋白质二级结构预测对确定蛋白质的空间结构和功能有极其重要的意义.融合卷积神经网络和贝叶斯优化模型,优化卷积神经网络的网络框架和超参数.采用优化后的卷积神经网络在测试集CASP9、CASP10、CASP11、CASP12、CB513和25PDB上获得了81.99％、81.36％、80.83％、78.10％、84.29％和84.80％的Q3准确率.实验结果表明,相比于其他方法,该模型提高了蛋白质3类二级结构预测的精度.