Comparaison du microbiote intestinal de 20 sujets atteints de pseudoxanthome élastique et 60 contrôles

Introduction Le pseudoxanthome elastique (PXE) est une maladie genetique entrainant un processus de calcification ectopique dermique, retinienne et vasculaire. L’heterogeneite phenotypique fait suspecter l’implication de facteurs environnementaux. La concentration plasmatique de la vitamine K (VK), un cofacteur d’enzymes regulatrices de la calcification principalement produit par la flore digestive pour la forme VK2, est basse au cours du PXE. La profondeur du deficit en VK pourrait etre un facteur de severite du PXE. L’objectif de l’etude IMPROVE est de rechercher une correlation entre la composition du microbiote intestinal, la concentration plasmatique des differentes especes moleculaires de VK dosables et la severite phenotypique du PXE. Materiel et methodes Vingt patients successifs atteints de PXE ont ete inclus dans cette etude. Leurs microbiotes intestinaux ont ete compares a ceux de 60 individus controles de meme sexe provenant de la base de donnees du laboratoire Biofortis ayant mene les analyses. Une technique de metabarcoding ciblant le gene codant pour l’ARN 16S de la flore intestinale a ete utilisee. Les comparaisons, portant sur les abondances relatives des taxa (phylum, famille, genre) et 4 indices de diversite alpha (Chao1 rarefie, Shannon, alpha de Fisher et Gini Simpson), ont ete realisees avec un test de Wilcoxon Mann Whitney (p-valeurs ajustees des comparaisons multiples a chaque rang taxonomique selon la procedure de Benjamini-Hochberg). Resultats Il existait des differences significatives en terme d’abondance relative entre les 2 groupes pour 2 familles de la flore intestinale : les Rhodospirillaceae (du phylum Proteobacteria) etaient plus abondantes dans le groupe PXE (moyenne 0,25 % vs 0,14 %, p = 0,0359) et les Sphingomonadaceae (du phylum Proteobacteria) plus abondantes dans le groupe controle (0,03 % vs 0,00 %, p = 0,0088). Dans cette famille, le genre Sphingomonas etait significativement plus abondant (0,03 % vs 0,00 %, p = 0,0221) dans le groupe controle. Deux indices de diversite alpha de la flore (Chao1 rarefie et alpha de Fischer) etaient significativement plus eleves dans le groupe PXE (respectivement p = 0,0012 et p = 0,0002). Discussion Le microbiote intestinal est un systeme complexe divise en phyla, subdivise en familles, genres et especes [SL1]. Les profils taxonomiques sont tres similaires dans leur globalite entre sujets PXE et sujets controles, mais il convient neanmoins de prendre en compte la faible taille de l’echantillon. Il existe une modeste difference quantitative significative pour 2 familles et 1 genre et sur 2 indices de diversite. Une etude attentive de ces familles est indispensable afin de connaitre leur impact sur la synthese de VK et potentiellement sur les phenomenes de calcification ectopique. Selon les resultats, des nouvelles perspectives therapeutiques pourraient etre envisagees.