绿藻ChlB基因和蓝藻NIES基因在溺死相关浮游生物检测中的应用

赵建, 肖成,万立华,杨幸怡,刘超,李越, 余仲昊,李欢, 徐曲毅

Fa yi xue za zhi(2021)

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摘要
目的 利用绿藻ChlB基因和蓝藻NIES基因,建立聚合酶链反应-毛细管电泳(polymerase chain reaction-capillary electrophoresis,PCR-CE)检测方法,验证该方法的特异性和灵敏度,并探讨其在溺死诊断中的应用价值.方法 针对GenBank中绿藻ChlB基因和蓝藻NIES基因的保守序列,设计特异性引物ChlB和引物NIES,以此构建PCR-CE检测方法.扩增50种标准样本DNA.阳性标准样本梯度浓度检测,确定灵敏度.检测25例尸体肺组织样本(溺死20例,自然死亡5例),同时比较微波消解-真空抽滤-自动扫描电镜法(microwave digestion-vacuum filtration-automated scanning electron microscopy,MD-VF-Auto SEM)的同步检测结果.结果 引物ChlB和引物NIES最低检测DNA含量分别为0.161、0.109 ng,可分别特异性扩增水体广泛存在的绿藻(蛋白核小球藻)和蓝藻[铜绿微囊藻(产毒及不产毒)],产物片段分别为156、182 bp,非溺死器官组织检测结果均为阴性.结论 构建的方法灵敏度高、特异性好,能很好地应用于溺死相关浮游生物检测,与MD-VF-Auto SEM法联用,可以增大溺死相关浮游生物的检测范围,提高溺死诊断的证据力.
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关键词
forensic pathology, forensic genetics, drowning, polymerase chain reaction, capillary electrophoresis, cyanophyte, chlorophyte, ChlB gene, NIES gene
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