中国东北鹿亚科动物亚化石的古DNA分子鉴定及系统发育分析

我国鹿类资源丰富,鹿亚科(Cervinae)动物有7个种在中国有分布.鹿亚科的种内系统发育研究很多,但是各物种之间进化关系仍有待进一步研究,其中从分子水平对古代材料的报道更为鲜见.对采集自黑龙江的两个距今分别为3800和5100 a的古代鹿亚科动物亚化石材料开展了古DNA研究.通过古DNA提取、古DNA双链文库构建、高通量测序及数据分析,得到了两条长度分别为16475 bp (GenBank收录号:MT784751,序列完整度:99.83％)和16167 bp (GenBank收录号:MT784752,序列完整度:97.96％)的线粒体基因组序列,对两个样品进行了分子鉴定.结合GenBank中现生鹿亚科动物的线粒体同源序列,构建了系统发育树.结果 表明:1)二代测序DNA片段末端碱基特性分析说明序列来自古代样品;2)两个样品代表的个体在系统发育树中均与马鹿聚类,在物种归属中被分子鉴定为马鹿(Cervuselaphus);3)黑龙江的两个古代样品与现生马鹿阿拉善亚种(C.elaphus alxaicus)亲缘关系最近,而与现生马鹿东北亚种(C.elaphus xanthopygus)亲缘关系较远.结合样品年代信息,说明两例样品代表的黑龙江古代马鹿种群,不是现生马鹿东北亚种的直系母系祖先.