野化培训与放归、野生大熊猫肠道菌群的组成和变化

追踪采集1只亚成年大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)在野化培训(N=4)、预放归(N=4)和放归(N=5)过程的粪样以及5个野生大熊猫粪样,基于高通量测序技术,研究大熊猫肠道细菌、真菌的组成和变化.结果发现,亚成年大熊猫肠道内细菌在门水平上以Firmicutes (61.33％)和Proteobacteria (35.09％)为主,在属水平上以Clostridium(39.68％)、Escherichia (20.94％)和Leuconostoc (8.75％)为主.真菌在门水平上以Ascomycota (81.56％),在属水平上以Humicola (26.43％)、Sphaerulina (12.42％)和Aspergillus (4.49％)为主.预放归大熊猫肠道细菌菌群的组成和放归大熊猫相似,但真菌菌群存在差异.随着培训—放归—野外的过程变化,细菌菌群丰富度和多样性差异不显著(P＞0.05),其中Chao-1指数呈上升趋势,而Shannon指数呈下降趋势.野外和培训大熊猫肠道真菌菌群的丰富度差异显著(P＜0.05),Chao-1和Shannon指数均呈上升趋势.同时发现,在细菌菌群中Leuconostoc的比例持续上升,而Acinetobacter和Zea比例持续下降.真菌菌群中Stachybotrys、Fusarium、Retroconis和Debaryomyces的比例持续上升,Cryptococcus和Lulwoayna比例持续下降.Clostridium、Bacillus、Sphaerulina和Aspergillus在放归过程中比例最高.本研究结果表明预放归过程肠道菌群不稳定,且真菌菌群的变化较明显,建议放归过程中缩短预放归时间;总体而言,野化培训与放归大熊猫肠道菌群的多样性、丰富度和结构组成逐渐向野生大熊猫趋近,野化培训与放归有利于大熊猫肠道菌群的重建,提高放归大熊猫的存活率.