摩拉水牛PRKAA2基因多态性与生长性状的关联分析

试验旨在探讨 PRK A A2基因在摩拉水牛群体中的遗传多态性及其与生长性状的关联性,进而得到显著相关的遗传标记,为摩拉水牛的分子标记辅助选择提供理论依据.利用 DNA 测序法等技术进行候选基因PRK A A2外显子4及部分内含子3单核苷酸多态性(SNPs)检测,并采用生物信息学方法结合统计软件分析PRKA A2基因与摩拉水牛生长性状的关联性.结果显示,摩拉水牛 PRK A A2基因中共检测到4个SNPs位点:c.462 G＞A 、IVS3.557 T＞C 、IVS3.560 C＞ T和IVS3.565 G＞A,均包含3种基因型,且符合 Hardy-Weinberg平衡.4个SNPs位点在水牛群体中均为中度多态,可以构建3种单倍型,T-C-G-G为优势单倍型,其中 IVS3.560 C＞ T与c.462 G＞A位点之间存在完全连锁不平衡,关联分析结果显示,单倍型H2与摩拉水牛体斜长和腰角宽呈显著相关(P＜0.05).c.462 G＞A位点与摩拉水牛体高、十字部高、尻长、坐骨端宽和腰角宽呈显著相关,其中GG和AA基因型个体的体高和十字部高均显著高于GA基因型个体,GG基因型个体的尻长显著高于GA和AA基因型个体,AA基因型个体的坐骨端宽和腰角宽显著高于GA基因型个体(P＜0.05);IVS3.557 T＞C位点与摩拉水牛的生长性状指标未达到显著相关(P＞0.05);IVS3.560 C＞T位点与摩拉水牛体高、十字部高和尻长呈显著相关,其中CC和TT基因型个体的体高和十字部高均显著高于CT基因型个体,CC基因型个体的尻长显著高于CT基因型个体(P＜0.05);IVS3.565 G＞A位点与体斜长呈显著相关,其中GG和GA基因型个体的体斜长显著高于AA基因型个体(P＜0.05).综上,PRK A A2基因的c.462 G＞A 、IVS3.560 C＞ T和IVS3.565 G＞ A位点对摩拉水牛部分生长性状均有显著影响,可作为摩拉水牛品种早期选育的候选基因和分子辅助标记.