新疆北疆部分地区致犊牛腹泻冠状病毒的分子流行病学调查

为调查新疆北疆部分地区规模化奶牛场致犊牛腹泻冠状病毒的感染情况,查明该病毒在致犊牛腹泻中的作用及分子流行病学特征,从新疆北疆的石河子、沙湾、奎屯、呼图壁地区的主要奶牛场采集1月龄以内犊牛粪便119份,其中腹泻犊牛粪便71份,相同日龄无腹泻的健康犊牛的粪便48份.采用反转录聚合酶链反应技术直接从犊牛粪便中扩增出牛冠状病毒N基因(597 bp)、S1基因(2 861 bp),并对牛冠状病毒S1基因进行测序、对比、分析.结果显示,从腹泻犊牛粪便中检出阳性样品12份,各牛场腹泻犊牛粪便的冠状病毒阳性检出率为0～38.89％,并未在健康犊牛粪便中检出牛冠状病毒.S1基因序列分析结果显示,与牛冠状病毒参考株Mebus、LY-138、OK、F15、L9、LSU的核苷酸和氨基酸序列的同源性分别在95.0％～97.7％、96.0％～98.6％之间.结果表明,此次调查的规模化奶牛场腹泻犊牛存在牛冠状病毒感染,所感染牛冠状病毒毒株与世界其他地区的参考毒株存在变异.