Détection d’ADN de mucorales par PCR quantitative dans le liquide de lavage broncho-alvéolaire : intérêt pour le diagnostic des mucormycoses

Objectif Plusieurs etudes retrospectives ont montre que la detection d’ADN de mucorales par PCR quantitative dans le serum permettait un diagnostic precoce des mucormycoses [1–4] . La PCR est desormais de plus en plus souvent appliquee pour la detection d’ADN fongique dans le liquide de lavage broncho-alveolaire (LBA). L’objectif de ce travail etait d’evaluer l’interet de la PCR sur le LBA pour le diagnostic des mucormycoses par une analyse retrospective des resultats des PCR Mucorales sur LBA realisees dans notre laboratoire ces 3 dernieres annees. Methodes Au total, 415 LBA (360 patients) ont ete recus dans notre laboratoire entre janvier 2013 et janvier 2017 avec une demande de PCR Mucorales. L’extraction d’ADN a ete realisee a partir du LBA a l’aide du kit NucleoSpin ® Tissue (Macherey Nagel, D’uren, Allemagne). La detection d’ADN a ete realisee par une combinaison de 3 qPCR ciblant les 4 genres principalement retrouves en France ( Lichtheimia , Rhizomucor , Rhizopus , Mucor ), comme decrit precedemment [3] . Resultats La PCR Mucorales sur LBA a ete negative chez 344/360 patients. Des resultats positifs de la PCR mucorales sur LBA ont ete retrouves chez 16/360 patients, avec un cycle seuil (Cq) median de 34,5 cycles, [ range  : 27–41]. Pour 4/16 patients, le diagnostic de mucormycose prouvee a ete retenu (Cq median : 35,5, [32–41]). Pour 5/16 patients, le diagnostic de mucormycose probable a ete retenu (Cq median : 29, [27–39]) ; ces 5 patients avaient egalement des PCR mucorales positives, pour la meme cible, sur le serum. Pour 2/16 patients, une autre infection fongique invasive (IFI) a ete diagnostiquee (1 aspergillose invasive probable [Cq = 35], 1 fusariose prouvee [Cq = 39]) ; ces 2 patients avaient egalement des PCR Mucorales positive sur le serum dans la meme periode, et la possibilite d’infection mixte a ete evoquee. Pour 4/16 patients, le diagnostic d’IFI possible avec PCR mucorales positives a ete retenu (Cq median : 36,5, [33–40]). Pour le dernier patient qui presentait une sarcoidose traitee par corticoides au long cours, le diagnostic de mucormycose n’a pas ete retenu (Cq = 41). Conclusion Ce premier travail, retrospectif, realise sur la totalite des prelevements « issus des soins » adresses a notre laboratoire, montre que la detection d’ADN de mucorales par qPCR sur le LBA permet d’obtenir un argument supplementaire en faveur du diagnostic de mucormycose. Les performances de cette technique sur le LBA pourront etre evaluees plus precisement dans le cadre du PHRC national ModiMucor.