P204: Omiques du tissu adipeux pour l’analyse des variations pondérales pendant et après une restriction calorique: une analyse de réseau pour l’intégration de données cliniques, du transcriptome et du lipidome

Nutrition Clinique Et Metabolisme(2014)

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摘要
Introduction et but de l’etude La comprehension des adaptations metaboliques et moleculaires du tissu adipeux (TA) accompagnant une perte de poids est essentielle dans le cadre de la recherche sur la physiopathologie de l’obesite. Dans ce contexte, les omiques, et particulierement la genomique du TA, ont permis d’ameliorer la connaissance de ces adaptations. Une approche innovante est d’integrer les jeux de donnees de plusieurs types de omiques afin d’avoir une vue globale et exhaustive sur les interactions entre chaque variable et de les relier a des evenements cliniques, tels les variations de poids. Le but de ce travail etait d’etudier les relations entre des variables bio-cliniques d’individus obeses, l’expression des genes et le contenu en acides gras (AG) du TA, a chaque etape d’un programme nutritionnel et en relation avec les variations ponderales. Materiel et methodes La determination du contenu en AG du TA sous cutane abdominal et les mesures d’expression de 221 genes ont ete realisees chez 135 femmes obeses de la cohorte europeenne DiOGenes, avant le regime, apres une phase de restriction calorique de 8 semaines et apres 6 mois de suivi ponderal ad libitum. Les individus ont ete stratifies a posteriori en 3 groupes selon les variations de poids apres la restriction. Afin d’etudier les relations entre les 3 jeux de donnees (AG, transcrits, variables bio-cliniques), une analyse de reseau basee sur un modele graphique gaussien a ete utilisee. Au sein de chaque jeu de donnees, les relations entre les variables ont ete etablies par estimation des correlations partielles. Les relations entre les variables de 2 jeux de donnees ont ete etudiees par une analyse de correlations canoniques regularisees. Une approche integrative a permis de fusionner tous les types de relations. Pour faire ressortir la macro-structure des reseaux, une classification de sommets a ete utilisee, permettant de generer des sous-reseaux. Les principaux sommets des sous-reseaux ont ete extraits et leur importance (centrealite) testee statistiquement. La fonction biologique des variables composant ces sous-reseaux reseaux a ete analysee. Resultats et Analyse statistique A la fin de la phase de suivi et dans le groupe de femmes reprenant du poids, 3 sous-reseaux sur 5 montrent des genes impliques dans des voies de croissance, angioge-nese et signalisation de proliferation, suggerant une hyperplasie. Apres la phase de restriction, une relation positive forte entre l’acide myristoleique (un AG peu represente dans le TA et dans l’alimentation) et des genes codant pour les principales enzymes de la lipogenese de novo a ete observee. A la fin de la phase de suivi, dans le groupe de femmes qui ont continue a perdre du poids, cette relation entre acide myristo-leique et genes de la lipogenese de novo est egalement retrouvee. Conclusion Cette approche originale de biologie des systemes apporte un regard nouveau sur la reponse du TA au controle ponderal, en soulignant le role central et inattendu de l’acide myristo-leique, qui pourrait etre un determinant de l’impact metabolique benefique de la perte de poids. La signature specifique du TA des femmes reprenant du poids suggere au contraire une signature hyperplasique defavorable.
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