2021-2022年上海<5岁住院儿童病毒性腹泻的病原学特征

Shanghai Journal of Preventive Medicine(2024)

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摘要
[目的]了解新型冠状病毒感染(简称"新冠")疫情防控期间住院儿童病毒性腹泻病原谱变化及主要病原体基因型别的流行变迁.[方法]采集上海市某哨点儿科医院本地<5岁腹泻住院患儿的粪便标本,采用荧光聚合酶链反应(PCR)方法对轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒进行分子检测,对主要病原体进行分子分型和序列分析.[结果]共收集546份标本,总体病毒阳性检出率为37.55%,依次为诺如病毒GⅡ型(22.16%)、A组轮状病毒(16.12%)、星状病毒(2.93%)、肠道腺病毒(2.38%)、札如病毒(0.92%)和诺如病毒GⅠ型(0.18%).诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4[P31]和GⅡ.4[P16]为主要流行株(占比分别为24.79%和14.05%),其中GⅡ.4[P31]检出占比明显下降(χ2=16.140,P<0.001).此外,还发现国内罕见轮状病毒基因型G8P[8]型在本地的首次流行,且占比呈上升趋势,总体达到7.95%.该基因型代表株在基因进化分析上与东南亚的DS-1-like G8P[8]毒株进化距离更近.[结论]诺如病毒基因亚型的分布变化和轮状病毒罕见型别的发现都凸显持续性病原监测和基因分型检测的重要性.少见株的本地化流行对上市疫苗的效果评价和潜在疫苗的开发提出了新的要求.
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关键词
pediatric inpatient,group A rotavirus,G8P[8]genotype,norovirus GⅡ
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