特发性肺纤维化并发肺动脉高压芯片数据差异表达基因分析

目的 分析特发性肺纤维化(IPF)并发肺动脉高压(PH)芯片数据差异表达基因.方法 检索基因表达谱汇编数据库(GEO)中的GSE15197数据.用Bonferroni算法得到可将IPF-PH、特发性肺动脉高压(IPAH)和正常对照3类肺组织样本区分开的差异表达基因.用主成分分析方法提取可区分3类样本的主成分,获取区分性的显著差异表达基因,用基因注释分析和基因间关联分析方法分析显著差异基因的功能和相关信号通路.结果 IPF-PH、IPAH和正常对照3组肺组织比较分析得到160个显著差异表达基因(P＜0.05),累计贡献率＞0.85的主成分有9个,在主成分1上荷载系数＞80％的显著性差异表达基因有44个.主要涉及纤毛、γ-谷氨酰胺转移酶、磷脂酶等生物学术语.差异表达基因主要涉及白三烯的生物合成以及γ-谷氨酰胺转移酶的生物活性相关信号通路.结论 差异表达基因及其功能注释可为IPF-PH致病基因提供重要线索,并为探寻潜在生物标志物和药物靶点提供理论基础.