动脉粥样硬化进展中差异免疫相关基因与免疫细胞的相关性及潜在干预中药的探索

目的:探讨动脉粥样硬化(AS)进展中差异免疫相关基因(DIRGs)与免疫细胞的相关性及干预DIRGs中药的一般规律.方法:首先,从GEO数据库中获取GSE28829数据集,从ImmPort数据库和MSigDB数据库中下载免疫相关基因.其次,利用limma包筛选GSE28829中早期AS斑块(EAP)和晚期AS斑块(AAP)间的差异表达基因,并与免疫相关基因取交集获取DIRGs;clusterProfiler包对DIRGs进行富集分析;构建DIRGs的蛋白互作网络,筛选网络中Hub基因.然后利用CIBERSORT反卷积法分析22种免疫细胞的浸润模式,筛选差异免疫细胞,并利用Pearson法分析其与Hub基因的相关性.最后,利用Core-mine Medical数据库预测干预DIRGs的中药,收集其性味归经信息.结果:共获得63个DIRGs,筛选出10个Hub基因(CD86、TLR2、TYROBP、CCR1、ITGB2、CCL2、CCL4、CSF1R、CXCR4、CTSS).富集分析结果显示,DIRGs的分子功能、生物学过程和信号通路与免疫调节密切相关.免疫细胞浸润分析结果显示,EAP中调节性T细胞、活化的树突状细胞、静息肥大细胞比例升高;AAP中记忆性B细胞、γδ T细胞、M0巨噬细胞、M2巨噬细胞比例升高.相关性分析结果显示,EAP中CD86与M2型巨噬细胞呈正相关;AAP中CD86、CTSS、CXCR4、CSF1R、ITGB2、TYROBP与M0巨噬细胞呈正相关,CCL4、CCL2与静息肥大细胞呈负相关.频次频率结果显示,干预DIRGs的中药大多归肝经、肺经,性味多为寒、苦.结论:本研究发现在AS的进展中有10个最重要DIRGs,7种免疫细胞出现失调,其中CD86、CTSS、CXCR4、CSF1R、ITGB2、TYROBP、CCL4、CCL2与静息肥大细胞、M0和M1型巨噬细胞存在相关性;同时,发现AS进展的免疫机制与中医肝经、肺经、味苦、味甘、性寒、性温密切相关.本研究结果可为后续探索AS进展的免疫学机制,以及中医临床精准遣方用药治疗AS提供借鉴和思路.