基于SNP芯片的盆周山地猪群体选择信号分析

为了分析盆周山地猪群体的选择信号,本研究利用猪 50K基因芯片,运用Tajima's D方法分析盆周山地猪群体基因组上受选择的信号区域,并通过生物信息学分析筛选受选择的候选基因.结果表明,盆周山地猪群体基因组上受选择的区域有 252 个,这些区域共包含 267 个候选基因,其中,在猪上已注释的基因 184个,如免疫性状相关基因MYO1G、CD86、IKF2,肉质性状相关基因PRKAG3、PRDM16、SND1,繁殖性状相关基因FSHR、LTF、AP3B1和生长性状相关基因SREBF2、SDC3、SLIT3.候选基因GO功能富集表明,这些基因参与了机体的免疫、行为、心管发育等生物学进程.KEGG信号通路分析发现,部分基因可能与催产素信号通路相关.本研究首次构建了盆周山地猪全基因组水平上的选择信号图谱,筛选了受选择的重要经济性状候选基因,研究结果为更好地保护、开发和利用盆周山地猪奠定了理论基础.