Coût des technologies de séquençage haut débit (NGS) : revue de la littérature et enseignements

Si les technologies de séquençage à haut débit (Next-Generation Sequencing [NGS]) révolutionnent la médecine, l’estimation de leur coût de production en vue de leur tarification par les systèmes de santé pose des questions méthodologiques. L’objectif de cette revue des études de coût des analyses NGS est de tirer des enseignements pour produire des estimations robustes du coût de ces techniques. Nous avons analysé selon une grille d’analyse comportant onze items les études de coûts de type micro-costing des analyses NGS (n=17) dont deux études menées en France. Les facteurs de variabilité entre les études que nous avons identifiés sont la temporalité (évaluation précoce de l’innovation vs évaluation d’une technologie mature), le choix de la méthode d’évaluation des coûts (périmètre, technique de micro- versus gross-costing), le choix des étapes de production observées et la transposabilité de ces études. Les enseignements que nous en retirons sont qu’il faut avoir une vision globale du processus de production du séquençage en intégrant toutes les étapes depuis le prélèvement de l’échantillon biologique jusqu’au rendu du résultat au clinicien. Il importe également de distinguer ce qui relève du contexte local de ce qui relève du contexte plus général en privilégiant le recours à des méthodes mixtes pour le calcul des coûts. Enfin, des analyses de sensibilité et une ré-estimation périodique des coûts des techniques doivent être effectuées pour pouvoir réviser les tarifs en fonction des évolutions liées à la diffusion de la technologie et au jeu de la concurrence entre les fournisseurs de réactifs.