Métodos moleculares avanzados para el monitoreo de muestras ambientales: una propuesta para Cuba

La diversidad y dinamica de comunidades microbianas ante cambios ambientales y nutricionales, asi como las relaciones metabolicas que se establecen resultan de especial interes para entender el funcionamiento de los ecosistemas. En este trabajo se describen las principales tecnicas moleculares utilizadas para determinar la estructura, diversidad, dinamica, o la identificacion microbiana en una muestra ambiental, ya sea de un ambiente natural (suelo agricola) o de un ambiente construido (digestor anaerobio). Ademas, se proponen estrategias de combinacion de metodos moleculares bajo enfoque polifasico basado en experiencias exitosas. Teniendo en consideracion las comunidades de diversas bacterias, arqueas y hongos que habitan los ambientes citados, se proponen desde los cebadores a utilizar para aislar genes consevados, las secuencias de sondas de ADN marcadas, hasta las combinaciones de tecnicas utilizables para caraterizar una comunidad microbiana bajo enfoque polifasico, segun su dinamica, diversidad, cuantificacion e identificacion. Las tecnicas metagenomicas clasicas y de ultima generacion constituyen herramientas poderosas para monitorear muestras ambientales, con un costo beneficio aceptable para paises como Cuba.