Diferenciación morfofisiológica y molecular por curvas de melting de alta resolución (HRMA) y secuenciación del complejo Trichophyton mentagrophytes en cepas humanas en Valparaíso, Chile

Revista Argentina de Microbiología(2020)

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摘要
Los miembros del complejo Trichophyton mentagrophytes representan el segundo grupo en frecuencia de aislamiento de dermatofitos, luego de Trichophyton rubrum. El citado complejo comprende 3 grupos principales: 1) Trichophyton benhamiae y especies relacionadas; 2) Trichophyton simii y 2 especies relacionadas, Trichophyton quinckeanum y Trichophyton schoenleinii, y 3) T. mentagrophytes, Trichophyton interdigitale y especies relacionadas. Todos estos organismos son difíciles de identificar a través de la morfofisiología. Se presenta en este informe un estudio descriptivo de 17 cepas clínicas aisladas e identificadas en el Laboratorio de Micología de la Universidad de Valparaíso como pertenecientes al complejo T. mentagrophytes, junto con la caracterización de 3 cepas de referencia (T. mentagrophytes CBS 318.56, T. interdigitale CBS 428.63, Trichophyton erinacei CBS 511.73), con el objetivo de clasificarlas a nivel de especie. Se realizaron pruebas morfofisiológicas y moleculares por análisis de curvas de melting de alta resolución (high resolution melting analysis) y secuenciación de regiones ITS. Fenotípicamente, se identificaron 3 especies incluidas en el complejo. Los análisis moleculares reclasificaron todas las cepas como pertenecientes a T. interdigitale. En conclusión, no se lograron establecer patrones morfofisiológicos confiables para poder diferenciar entre las especies del complejo. Trichophyton mentagrophytes complex is the most frequent agent found in dermatophyte isolates after Trichophyton rubrum. It is divided into 3 main groups: (1) Trichophyton benhamiae and related species; (2) Trichophyton simii and 2 related species, Trichophyton quinckeanum and Trichophyton schoenleinii; and (3) T. mentagrophytes, T. interdigitale, and related species. They are all difficult to identify by morphophysiology. With the aim of classifying them at the species level, a descriptive study was performed on 17 isolated clinical strains identified in the Mycology Laboratory of the Universidad de Valparaíso as belonging to the T. mentagrophytes complex. They were compared with 3 reference strains (T. mentagrophytes CBS 318.56, T. interdigitale CBS 428.63, Trichophyton erinacei CBS 511.73). Morphophysiological and molecular tests were performed by high resolution melting analysis curves and ITS regions sequencing. Phenotypically, 3 species of the complex were identified. Molecular analyses reclassified all the species as belonging to T. interdigitale. In conclusion, no reliable morphophysiological patterns were established to differentiate between the species of the complex. Molecularly, all the strains studied were classified as T. interdigitale.
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