辣椒MADS-box基因家族的鉴定及表达分析

YANG Guangbin, WANG Jin, CHEN Kailin, SHAN Qingyun,CUI Sufei, XIONG Cheng,ZOU Xuexiao,LIU Feng

Journal of Hunan Agricultural University(Natural Sciences)(2023)

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摘要
利用辣椒的全基因组数据鉴定到104 个MADS-box基因,对它们的理化性质、染色体定位、系统进化关系、蛋白保守基序和组织表达水平进行分析.结果表明:辣椒MADS-box基因家族各成员在染色体上的分布不均,理化性质差异较大,104个家族成员编码的氨基酸长度为100~567 aa,蛋白相对分子质量为11 203.9~63 559.7,蛋白理论等电点(PI)为4.63~10.46,系统进化树分析结果表明,辣椒MADS-box基因家族可分为2 大类,与拟南芥和番茄的进化关系类似;组织表达水平分析结果表明,CaMADSs 主要在花、果实和种子中表达,在叶片中表达量相对较低,推测MAD S-box基因可能参与调控果实的发育和成熟.
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关键词
pepper,MADS-box gene family,gene expression
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