新定义的可预测肝癌预后的焦亡相关lncRNA模型

Chinese Archives of General Surgery (Electronic Edition)(2023)

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摘要
目的:通过构建细胞焦亡有关的长链非编码核糖核酸(lncRNA)模型,并在独立的肝细胞癌(HCC)患者队列中对其功能进行验证,从而进一步明确HCC中焦亡相关lncRNA的表达及其与预后的相关性。方法:使用癌症基因组图谱(TCGA)队列评估每个焦亡相关lncRNA对生存的预后价值,以构建多基因特征。通过应用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法,构建4种lncRNA模型,并将TCGA队列中的所有HCC患者分为低危组或高危组。结果:低危组HCC患者的生存可能性显著高于高危组。风险评分是预测HCC患者预后的独立因素。治疗药物(吉西他滨、多柔比星、丝裂霉素C和索拉非尼)敏感性和免疫细胞(肥大静息细胞、单核细胞、NK静息细胞、CD8+ T细胞和M0巨噬细胞)表达量在两组患者之间差异有统计学意义(P<0.05)。基因本体论(GO)和京都基因与基因组大全(KEGG)的分析显示了两组间的差异性富集途径。差异性基因富集分析显示,针对Wnt/β-catenin信号通路有助于制定HCC患者的治疗策略。结论:本研究发现了与焦亡有关的lncRNA新模型,可作为HCC患者的独立预后指标,为制定可靠、精确的癌症治疗方案提供了全新的观点。
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