干酪乳杆菌HDS-01甘露聚糖酶基因克隆及生物信息学分析
Chinese Agricultural Science Bulletin（2023）
摘要
本研究旨在借助基因克隆和生物信息学方法挖掘甘露聚糖酶基因的结构和功能.通过本地BLAST比对,从干酪乳杆菌(Lactobacillus casei)HDS-01的基因组信息中获得甘露聚糖酶基因M1.采用qRT-PCR测定MRS培养基和KGM培养基中M1的差异表达情况,表明KGM培养基中的魔芋粉更好的诱导M1的表达.以L.casei HDS-01基因组DNA为模板克隆基因M1,并利用生物信息学方法对其序列进行预测和分析.该序列长2640 bp,可翻译成879个氨基酸,包括一个2640 bp的开放阅读框;M1蛋白分子量为98723.55 Da,等电点为5.58.这种稳定的M1蛋白的二级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲组成.研究结果不仅为甘露聚糖酶分子改造提供理论依据,同时有助于了解乳酸菌中甘露聚糖的代谢路径.
更多关键词
Lactobacillus casei,bioinformatics analysis,clone,mannanase,protein secondary structure
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