基于SSR标记构建叶子花品种的分子身份证

GUO Yun,ZHENG Yongqi, ZONG Yichen, CHU Aixiang, LIN Furong, HUANG Ping

Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition)(2023)

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摘要
以 219 个叶子花栽培品种为研究对象,在 140 对引物中筛选出 20 对多态性高的简单重复序列(SSR)荧光标记引物对219 个品种进行扩增,共扩增出 414 条带型,平均每对引物扩增出 20.7 条;20 对引物的多态性信息含量(PIC)为 0.189~0.823,平均值为 0.696,当PIC>0.50 时可以认为该引物为高度多态性信息引物;20 对引物在 219 个品种中共检测出 219 个等位基因,平均每对引物检测出 10.95 个;20 对引物在 219 个品种组成的群体中,其平均有效等位基因数为 4.212 个,平均Shannon多样性指数为 1.633,平均观测杂合度为 0.430.在构建叶子花品种分子身份证方面,通过SSR标记技术,根据PIC的高低选择引物组合,采用数字与英文大小写字母相结合的方法,对不同长度的扩增片段进行赋值,最终用 20 对引物构建了 219 个叶子花品种的分子身份证,并通过在线软件进一步转换成唯一可识别的品种信息二维码.叶子花品种分子身份证和信息二维码的构建,可避免出现由于品种繁多及命名混乱而导致的同名异物和同物异名的现象,促进品种知识产权保护,做到种质可追溯.
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关键词
Bougainvillea,simple sequence repeats marker,molecular ID
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