The Therapeutic Effect and Targets of Shudi Suoyang Formula(熟地锁阳方)on Idiopathic Pulmonary Fibrosis were Preliminarily Explored Based on the Molecular Docking Technology and Experimental Verification

ZHANG Ning, GUO Yali,PENG Yanru, WANG Yuguang

Guiding Journal of Traditional Chinese Medicine and Pharmacology(2023)

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摘要
目的:运用分子对接技术与动物实验验证相结合的方法,对熟地锁阳方治疗特发性肺纤维化(IPF)的疗效及其可能的作用靶点进行探究.方法:应用TCMSP结合BATMAN-TCM数据库收集熟地锁阳方的有效成分及其作用靶点,通过Degree评分选取分数较高的化合物作为配体进行分子对接.应用GeneCards、PharmGkb及OMIM等数据库获得疾病靶基因,将药物潜在作用靶基因与疾病靶基因取交集,利用CytoNCA进行拓扑分析,筛选获得核心作用靶点.根据核心靶点及文献研究选取相关靶点作为大分子受体,应用Autodock-Vina软件进行分子对接.同时建立肺纤维化小鼠模型,通过体内动物实验进行验证,运用EMMS eSpira Forced Maneuvers有创肺功能仪检测小鼠的用力肺活量(FVC)、吸气能力(IC),收集小鼠的肺组织、称重并计算肺系数,分别运用HE和Masson法观察小鼠的肺组织病理学变化,Western blotting法检测α-SMA蛋白相对表达量,实时荧光定量PCR检测VEGFA mRNA、EGFR mRNA相对表达量.结果:共获得115个有效化合物,Degree≥ 110的化合物共有5个,共筛选得到VEGFA、EGFR、MAPK1、TP53、AKTI、MAPK14、TNF、FOS、JUN 9个核心作用靶点.分子对接结果显示,VEGFA、EGFR与上述化合物均存在结合活性,且绝大部分靶点与有效化合物的结合活性较强.动物实验结果表明,与对照组比较,模型组小鼠肺功能FVC、IC均明显降低(P<0.01),肺系数及肺组织中α-SMA蛋白相对表达量均明显升高(P<0.01),肺组织病理学显示结构明显被破坏、炎症细胞渗出及胶原沉积增多,肺组织中VEGFA mRNA、EGFR mRNA相对表达量均明显升高(P<0.01);与模型组比较,熟地锁阳方组小鼠肺功能FVC、IC均明显升高(P<0.01),肺系数及肺组织中α-SMA蛋白相对表达量均明显降低(P<0.01),肺组织结构改善明显、炎症细胞渗出及胶原纤维沉积明显减少,肺组织中VEGFA mRNA、EGFR mRNA相对表达量均明显降低(P<0.01).结论:熟地锁阳方具有抗肺纤维化的作用,其作用靶点可能与VEGFA、EGFR有关.
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关键词
idiopathic pulmonary fibrosis,Shudi Suoyang Formula,molecular docking technology,thera-peutic effect,targets of action,mice
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