2018-2021年甘肃省猪流行性腹泻病毒的演化重组分析
Animal Husbandry & Veterinary Medicine（2023）
摘要
猪流行性腹泻病毒(PEDV)对养猪业造成了巨大的损失.为了解甘肃省PEDV的流行情况,本研究在2018-2021年间收集了甘肃省43个猪场的腹泻猪肠内容物样本,利用RT-PCR方法对PEDV进行检测,并测定病毒的全基因组序列,绘制进化树,进行重组分析.结果显示,PEDV阳性率为95.3％(41/43),是引起猪腹泻的主要病原.本研究随后选择2株病毒进行分析.结果显示,这2株PEDV为GⅡ-c型,其S基因均发生了重组事件,与疫苗株亲缘关系较远.本研究首次发现甘肃省内出现GⅡ-c型PEDV的流行,其S基因重组自GⅡ-a型PEDV.该发现为猪流行性腹泻的诊断和防控提供了依据.
更多关键词
porcine epidemic diarrhea virus,polygenetic analysis,recombination analysis
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