基于TCGA研究铁死亡相关基因对乳腺癌患者的预后

乳腺癌是起源于乳腺上皮组织的恶性肿瘤,是一种高度异质性的疾病,这使得研究其乳腺癌的预后具有挑战性.铁死亡是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式.因此,铁死亡相关基因在乳腺癌中的预后价值的研究是有必要的.本研究从公共数据库下载了乳腺癌患者的mRNA表达谱及相应的临床资料.使用LASSO Cox回归在TCGA队列中构建多基因预后模型.来自MRTABRIC队列的乳腺癌患者被用于验证.结果 显示,在TCGA队列中,大多数与铁死亡相关的基因(79.1％)在肿瘤和邻近正常组织之间差异表达.在单因素Cox回归分析中,20个差异表达基因与预后生存相关(P＜0.05).本研究构建了一个16个铁死亡相关基因的预后模型,将患者分成高、低风险两组人群,与低风险组相比,高风险组总体生存率明显降低(P＜0.001).在多因素Cox回归分析中,风险得分可以作为独立的预后因子(P＜0.001).此外,本研究根据预后模型,对患者数据进行高、低风险分组,求其风险差异.据差异表达基因进行GO分析、KEGG分析和ssGSEA分析,发现和免疫相关通路有关(P＜0.05).总之,16个铁死亡相关基因可以用于预测乳腺癌的预后,并有利于进一步指导临床治疗.