长链非编码RNA与mRNA在烟雾吸入性损伤小鼠肺组织中的差异表达

Liu Xinjian, Cui Zhengjun,Xia Siman,Wang Changyin, Guo Pengfei, Wang Xu,Yu Zugai, Qian Kun

Infection Inflammation Repair(2020)

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摘要
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA在烟雾吸入性损伤小鼠肺组织中的差异性表达.方法:对6只烟雾吸入性损伤小鼠和3只正常小鼠肺组织进行RNA的高通量测序,通过对其中表达量发生变化的转录本进行比较,获得烟雾吸入性损伤小鼠肺组织中差异表达的lncRNA及mRNA.最后,采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)验证差异lncRNA分子.结果:烟雾吸入小鼠肺组织出现中、重度损伤,表现为间质内有大量炎性细胞浸润,充血,肺组织结构破坏.高通量测序及生物信息学分析发现,烟雾吸入性小鼠肺组织相比正常小鼠肺组织有1008个mRNA差异表达,其中上调369个,下调639个,差异表达mRNA高度富集到与炎症与免疫相关通路.烟雾吸入性损伤小鼠肺组织相比正常小鼠有2071个lncRNA差异表达,其中上调286个,下调1785个,差异表达lncRNA的靶标集中富集到转录调控和炎症免疫相关通路.经qRT-PCR验证,确定了lncRNA AU019990、lncRNA Gm29264、lncRNA Gm28707、lncRNA 5830405F06Rik在对照组和烟雾吸入性损伤组的差异性表达.结论:烟雾吸入性损伤后,lncRNA差异性表达显著,可能介导了转录调控、炎症免疫等相关生理病理过程,因而可能是一类潜在的药物靶标.
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