基于RNA高通量测序研究右美托咪定对人神经母细胞瘤细胞基因表达的影响

GUAN Wei, BAI Yunfeng, DU Shengjie,WANG Yuelan,LI Ximing

Journal of Shandong University (Health Science)(2023)

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摘要
目的 分析右美托咪定对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞表达谱差异的影响,探讨右美托咪定在脑保护中的潜在机制.方法 培养 SH-SY5Y 细胞,分为实验组(T 组,生物学重复 n= 3)和对照组(C 组,生物学重复n=3).实验组用右美托咪定刺激 48 h,对照组相同条件下用 DMSO 处理.使用 Trizol 提取 RNA,在 Illumina Novaseq平台进行RNA测序.采用Limma分析实验组与对照组的差异基因,并对差异基因进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果 T组与C组相比,共有 211 个差异表达基因(上调 105 个,下调 106 个).其中FGF1、GNG13、P2RY4 在实验组和对照组中表达差异明显,差异倍数分别为 2.23、2.00 和 6.56.GO富集分析示差异基因主要富集于磷脂酶C活化的G蛋白偶联受体信号通路、蛋白激酶B信号的调控、BMP信号通路.KEGG通路富集分析示差异基因主要富集于白细胞跨内皮迁移.结论 FGF1、GNG13、P2RY4 等基因可能参与右美托咪定对脑的保护作用.右美托咪定可能主要通过炎症机制参与对中枢神经系统的保护.
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关键词
Dexmedetomidine,RNA high-throughput sequencing,SH-SY5Y cells,Brain protection,Central nervous system
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