苦荞糖转运载体FtSWEETs的鉴定与生物信息学分析

植物SWEET转运蛋白是介导糖类进行跨膜运输的重要载体.本研究基于苦荞转录组测序数据库,筛选到34个FtSWEETs基因.基因序列分析发现,苦荞FtSWEETs基因序列长度为533～2 890 bp,编码氨基酸残基为51～327个.聚类分析发现,苦荞FtSWEETs被归为4类,4个属于类型Ⅰ,9个属于类型Ⅱ,6个属于类型Ⅲ,11个属于类型Ⅳ.蛋白序列分析发现,29个FtSWEETs的最长开放阅读框(MaxORF)编码蛋白具有跨膜结构域.基于苦荞茎的转录组测序分析,共检测到15个FtSWEETs基因在苦荞幼苗茎中表达,包含11个差异表达基因(DEGs).其中,4个DEGs在出苗后5 d的茎中高表达,随后急剧下降;4个DEGs在出苗后5～15 d的茎中表达量逐渐下降;1个DEG在出苗后10和15 d的茎中高表达,2个DEGs在出苗后15 d的茎中高表达,推测这可能与它们在不同发育阶段发挥特定功能有关.相关性分析发现苦荞FtSWEETs基因间存在多个显著正相关或负相关关系,说明其可能存在协同或功能互补效应.本研究为进一步探索苦荞糖转运的分子调控机制提供了依据.