水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析

Ma Yinhua, Liu Taomei,Wan Tianxue, Xiao Xinbo, Hu Qiong,Li Pingfang,Duan Renyan, Zhang Bin,Jin Chenzhong,Du Bo

Shandong Agricultural Sciences(2023)

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摘要
类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases,RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶,在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能.在对水稻RLCK Ⅵ家族成员OsRRK1 基因的研究中发现水稻 4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因,即OsRLCK167(LOC_Os04g56060).为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用,本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167 基因进行生物信息学分析;采用qRT-PCR技术对OsRLCK167 基因做组织表达模式分析.结果显示:OsRLCK167 蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白;对该蛋白的二级结构进行预测,显示其主要由无规则卷曲(41.94%)、α-螺旋(35.29%)、延伸链(15.35%)和β-转角(7.42%)组成;该基因在水稻不同组织均有表达,且在叶鞘中的表达量最高.结果表明,OsRLCK167 基因在进化过程中具有高度的保守性,在水稻中具有功能多样性.
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