1株G26P[23]型猪A群轮状病毒的基因组特征

目的 分析2021年从福建省发生腹泻的猪场分离到的1株G26P[23]新基因型猪轮状病毒RVA/pig/CHN/FJSH01/2021/G26P[23](简称FJSH01)的分子特征.方法 利用MARC-145细胞进行RV分离,采用RT-PCR方法对分离株FJSH01的全基因组进行了测定,利用在线分型工具RotaC v2.0对其基因型进行鉴定,并对其分子遗传特征进行了分析.结果 分离株 FJSH01 的基因型图谱为 G26-P[23]-I5-R1-C1-M1-A8-N1-T1-E1-H1,即 G26P[23]型.分离株 FJSH01 的VP3、NSP1、NSP3 和 NSP5 基因分别与人源轮状病毒 RVA/Human_wt/VNM/30378/2009/G26P[19]、RVA/Human-wt/VNM/NT0077/2007/G4P[6]、Human/LL4260/China/T1 和 RVA/Human/Ryukyu-1120 的核苷酸同源性最高,为 96.01％～98.65％,其余7个片段与猪源轮状病毒(PoRV)的核苷酸同源性最高,为95.12％～97.99％,表明分离株FJSH01可能为人源轮状病毒和猪源轮状病毒重配后的病毒株.结论 G26P[23]型PoRV为国内首次鉴定,研究结果丰富了 PoRV分子流行病学资料,为PoRV预防控制提供理论参考.