产肠毒素大肠埃希菌PCR检验方案的优化

目的 分析产肠毒素大肠埃希菌stp毒力突变基因序列,及时优化监测方案,对食品中的产肠毒素大肠埃希菌进行有效的监测.方法 利用生物信息软件对测序结果进行比对,分析变异位点.通过评估不同引物探针检测方案对性能的影响,确定最优的解决方案.结果 通过基因序列测定,发现stp基因监测方案中上游引物第15号位置和16号位置发生了突变,NCBI中stp基因序列共63条,这条stp上游引物方案经过序列分析发现第15号位的T突变成A的共有12条,占比19％.第16号位的C突变成A的有11条,占比17％.优化后的stp检测方案能够正确扩增,除检出目标菌特异性条带无非特异条带产生,灵敏度达到0.05 ng/μl.结论 优化后的检测方案准确度高,特异性好、灵敏度好,并且不干扰其他毒力基因的检测性能,满足食品中对产肠毒素大肠埃希菌的检测要求.