基因芯片和RNA-seq联合组织芯片分析CLDN8在乳头状肾细胞癌的表达及意义

目的 联合基因芯片或RNA测序技术及免疫组织化学染色探究CLDN8在乳头状肾细胞癌(PRCC)中的表达及其临床意义.方法 通过Gene Expression Omnibus数据库、Sequence Read Archive数据库、Array Express数据库、癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集PRCC的组织mRNA表达数据集和开展免疫组织化学染色实验检测CLDN8的表达水平,非配对独立样本t检验用于分析CLDN8在癌组织与非癌组织的表达差异.数据偏倚通过Deeks'和Egger's检验评价.标准化均数差(SMD)、灵敏度、特异度、似然比、汇总受试者工作特性曲线用于评估CLDN8的临床价值.收集TCGA数据库中PRCC患者的临床病理参数,通过非配对独立样本t检验或方差分析探究CLDN8表达与患者临床病理特征之间的关系.结果 共筛选出7个数据集,包括500例PRCC组织和111例非癌组织,CLDN8在PRCC中显著低表达(SMD=-6.80,95％CI:-8.97～-4.63),在PRCC与非癌组织表达差异具有极显著统计学意义(P＜0.000 1),汇总受试者工作特性曲线下面积趋近于 1.00(95％CI:0.99～1.00),灵敏度为 0.99(95％CI:0.93～1.00),特异度为 0.99(95％CI:0.83～1.00),阳性、阴性似然比分别为103.39(95％CI:5.16～2 069.90)、0.01(95％CI:0.00～0.08).整体未检测到明显的发表偏倚.CLDN8表达水平与患者性别、年龄、分级分期无明显关联.结论 CLDN8表达水平在PRCC中降低,可能与PRCC的发生、发展相关.