2016-2020年安徽省手足口病流行病学特征及CVA6基因进化分析

Chinese Journal of Virology(2023)

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摘要
为了解安徽省2016-2020年手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)流行特征与病原谱构成,及分析CVA6(Coxsackievirus A6,CVA6)VP1区基因进化情况.本研究收集2016-2020年安徽省HFMD病例流行病学资料,描述性流行病学方法分析病例三间分布情况.随机选取480份HFMD其他肠道病毒阳性咽拭子样本,RT-PCR扩增肠道病毒VP1基因片段,测定基因序列并鉴定其他肠道病毒基因型别.生物软件分析部分代表性CVA6基因序列相似性并构建系统发育树.流行病学结果显示,2016-2020年安徽省HFMD发病率仍处于较高水平,但重症病例与死亡病例数有所减少,5个年度均以其他肠道病毒流行为主,五岁以下散居儿童为主要患病人群,男女性别比为1.50:1.2016-2019年度发病均呈现为双峰流行模式.病原分型鉴定结果为CVA6 215例(215/245,87.76%),CVA10 16 例(16/245,6.53%),CVA4 12 例(12/245,4.90%),CVA5 1 例(1/245,0.41%),CVA2 1 例(1/245,0.41%).选取的60株代表性CVA6 VP1区序列相似性分析表明,各序列间VP1核苷酸序列相似性为91.6%~100%,氨基酸序列相似性为97.4%~100%;与D3基因型代表株之间核苷酸序列相似性为90.7%~98.9%,氨基酸序列相似性为96.7%~100%;与CVA6原型株核苷酸序列相似性为82.3%~83.9%,氨基酸序列相似性为95.1%~96.7%.进化分析显示,CVA6划分为A-D四个基因型,60株CVA6毒株均属于D3基因亚型中的D3a分支,为中国大陆地区优势流行型别.应加强对安徽省CVA6及其他肠道病毒监测,这对制定减轻HFMD疾病负担以及防控HFMD策略具有重要意义.
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