铁死亡基因及相关长链非编码RNA在肝细胞癌发生与预后中的作用

China Medical Herald(2022)

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摘要
目的 探讨肝细胞癌中铁死亡的作用机制及其相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后价值.方法 从TCGA数据库下载肝癌转录组数据,筛选铁死亡差异基因并进行富集分析;相关性检验获取与铁死亡相关的lncRNA;使用Cox回归分析构建预后模型.根据风险评分公式计算风险得分,并将队列中的肝癌患者分为高、低风险组,并对其进行生存分析及免疫差异分析.结果 筛选出84个铁死亡差异基因.富集分析显示与mTOR代谢、糖酵解、γ干扰素应答等相关,纳入17个铁死亡lncRNA构建预后模型.低风险组预后优于高风险组(P<0.01);受试者操作特征曲线表明该模型具有良好的预测能力.免疫微环境分析发现,多种免疫细胞具有浸润差异,且鉴定出17个具有表达差异的免疫检查点.结论 铁死亡基因及相关lncRNA在肝癌中都起着重要的调控作用,且免疫微环境的变化也是肝癌治疗的潜在靶标.
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