松材线虫USP基因家族鉴定及生物信息学分析

泛素特异性蛋白酶(USP)作为去泛素化酶的一种,在生物体内细胞发育、信号传递、肿瘤发生和转移及免疫反应等诸多方面发挥着重要功能.通过生物信息学的方法从松材线虫基因组中筛选并鉴定松材线虫USP家族基因19个,通过分析其理化特性、进化发育、蛋白及基因结构及表达模式,为研究USP家族在松材线虫发育中的作用奠定基础.结果表明,松材线虫USP不均匀的分布于6条染色体上;理化性质分析发现松材线虫USP基因家族编码的氨基酸为280～1 384个,分子质量介于31.53～158.94ku,等电点介于4.77～9.43;基因和蛋白结构分析表明松材线虫USP家族是一个活跃的去泛素化酶家族.根据在不同发育阶段的松材线虫中USP家族表达模式分析发现,松材线虫USP家族对松材线虫胚胎发育和生长过程中具有一定的促进能力.因此,研究松材线虫USP家族的结构和表达模式对解析松材线虫发育趋势具有一定的指导意义,对探索松材线虫防治方法具有参考价值.