基于生物信息学探讨祖卡木颗粒对急性肺损伤的保护机制

目的 应用系统生物信息学方法,构建祖卡木颗粒对急性肺损伤(ALI)的表征-基因-通路网络,并进行药效学实验验证,探讨其作用机制.方法 利用TCMSP及中国知网(CNKI)、万方数据知识服务平台、PubMed数据库搜集祖卡木颗粒中10种药物的活性成分和靶点,并通过SwissTargetPrediction数据库补充药物靶点.利用GeneCards、OMIM数据库获取ALI相关靶点,GEO数据库获取ALI差异表达基因,运用jvenn在线工具获取祖卡木颗粒抗ALI的潜在靶点.利用STRING数据库构建关键靶点的蛋白相互作用网络并进行可视化,通过DAVID数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析.采用脂多糖诱导建立ALI大鼠模型,HE染色观察肺组织病理变化,RT-qPCR检测肺组织CD14、CD80、CD86 mRNA表达水平.结果 筛选得到祖卡木颗粒共174个活性成分和825个作用靶点,与ALI靶点有46个共同的差异基因;获得327条GO生物过程和137条相关信号通路,涉及TNF、IL-17、Toll样受体、NOD样受体信号通路.实验结果显示,祖卡木颗粒可显著减轻ALI大鼠肺组织损伤程度,抑制大鼠肺组织CD14、CD80、CD86 mRNA表达.结论 祖卡木颗粒能够有效抑制ALI大鼠肺组织CD14和共刺激分子CD80、CD86 mRNA表达,抑制机体过激的免疫炎症反应,其作用机制可能与调控TNF、IL-17、Toll样受体等信号通路有关.