基于分子对接技术对黄芪治疗Ⅱ型糖尿病的物质基础及作用机制的研究

为阐明黄芪治疗Ⅱ型糖尿病的有效成分及作用机制,选取黄芪中的87个化学成分,以α-葡萄糖苷酶、二肽基肽酶-4等9个与Ⅱ型糖尿病相关的靶标蛋白为研究对象,以各靶标对应的上市药物及活性小分子作为参照,利用Maestro 11.2软件中的Ligand Docking分子对接程序研究化合物与靶标蛋白的相互作用.结果显示,有14个化合物可能是黄芪治疗Ⅱ型糖尿病的有效成分,其中11个化合物可同时作用于2个或2个以上靶点,且多数为黄酮类化合物.多数化合物与AMPK、DPP-4、PPARγ 以及FFAR1靶点具有较好的结合效果.对代表化合物MOL00415的作用方式进行分析,结果表明,化合物与靶标蛋白结合口袋中的ASP、ARG、LYS、THR等极性氨基酸可形成氢键作用和静电作用,与非极性氨基酸VAL、TRP等存在疏水作用.