野菊bZIP转录因子全基因组鉴定及生物信息学分析
Molecular Plant Breeding（2022）
摘要
野菊(Chrysanthemum indicum)是重要的资源植物,广泛分布于东北、华北、华中、华南和西南地区,具有较高的药用和观赏价值.bZIP转录因子参与许多种植物的生物学过程,对植物抵抗逆境胁迫起着较高的调控作用.利用生物信息学分析的方法在野菊全基因组数据库中对野菊bZIP转录因子进行全基因组鉴定,预测和分析基因结构、蛋白性质、蛋白结构、启动子.结果表明,野菊bZIP转录因子家族共有75个基因;亲缘关系较近的野菊bZIP基因的基因结构较为相似;保守基序分析结果表明,每个基因所包含的保守基序的种类、数量及分布位置具有一定相似性,但也存在差异;聚在同一亚家族的基因所含有的保守基序的种类、数量和分布位置相似.bZIP转录因子家族基因的启动子中有多种顺式作用元件,其中光反应性元件最多,其次是植物激素反应性元件.野菊bZIP转录因子家族的分析结果可为进一步研究野菊bZIP基因的功能和分子机制提供了依据.
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