极小种群野生植物独龙江空竹遗传多样性研究

目的:了解云南省极小种群野生植物独龙江空竹(Cephalostachyum mannii)种质资源的遗传结构和遗传多样性.方法:对野外采集到的30个独龙江空竹个体进行RAD测序,通过质控获取高质量单核苷酸多态性位点(SNPs),利用生物信息学软件进行遗传结构和遗传多样性分析.结果:(1)筛选过滤共得到66339个高质量SNP位点,SNP转换与颠换的比值(Ts/Tv)为1.75,转换大于颠换;(2)系统发育树分析将独龙江空竹划分为四个支系,主成分分析和主成分判别分析显示其没有明显的分组,群体结构分析显示其最优分群数为1;(3)通过对独龙江空竹四个支系进行遗传多样性分析发现,第Ⅰ支系遗传多样性相对较高,但物种水平上独龙江空竹遗传多样性水平较低(PPL=16.24％,Ho=0.217,He=0.252,π=0.257,Fis=0.157).结论:分布于云南省的独龙江空竹具有较低的遗传多样性,没有明显的遗传结构,应加强对独龙江空竹天然种群的保护.