基于转录组测序揭示青黄散治疗骨髓增生异常综合征的作用机制

目的 研究青黄散治疗骨髓增生异常综合征(Myelodysplasticsyndrome,MDS)的潜在分子靶点及作用机制.方法 研究纳入 15 例MDS患者,在治疗前以及青黄散治疗 6 个月后提取骨髓样本,以转录组测序检测治疗前后骨髓单个核细胞基因的差异表达,并通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析对差异表达基因进行功能富集分析.利用Cytoscape 3.9.1 软件构建差异表达基因蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);为了验证体内结果,选取MDS细胞株MUTZ-1 作为实验对象作体外实验,以青黄散主要有效成分硫化砷为干预手段,使用实时定量PCR验证测序结果.结果 转录组分析证实,与治疗前比较,经青黄散治疗6 个月后MDS患者骨髓有核细胞有 2841 个差异表达基因,包括 1892 上调基因和 949 个下调基因,GO功能富集分析发现这些差异表达基因参与了组蛋白修饰这一与MDS 高度相关的生物过程.KEGG分析发现,HIF-1、TNF-α及VEGF等信号通路可能是青黄散治疗MDS的潜在通路.根据GO富集分析结果,组蛋白修饰差异表达基因被用于构建PPI蛋白互作网络并进行核心基因的筛选,进一步体外验证实验发现,硫化砷干预MDS细胞株后EP300、HDAC7 与SETD2 较对照组显著上调,HDAC6 显著下调,与测序结果一致.结论 组蛋白修饰是青黄散治疗MDS的重要作用机理,可能涉及EP300、HDAC6、HDAC7 与SETD2 等分子靶点.