鳙鱼肠道菌群多样性及潜在益生菌的分离鉴定

该研究利用三代16S rRNA扩增子测序技术分析天然池塘生境鳙鱼肠道菌群特征,并从中分离潜在益生菌.该生境鳙鱼肠道菌群以厚壁菌门(Firmicutes,10.28％)和变形菌门(Proteobacteria,21.47％)为主.在属水平上,以未命名菌属ZOR006(21.63％)、严格梭菌属(Clostridium_sensu_stricto_1,10.84％)、罗姆布茨菌属(Romboutsia,10.34％)、类梭菌属(Paeniclostridium,9.63％)、甲基孢囊菌属(Methylocystis,8.74％)为主.为分离到既有利于营养物质的吸收又能抑制病原微生物的鳙鱼源芽孢杆菌(Bacillus),对从该生境鳙鱼肠道中分离的菌株进行产酶、抑菌等功能相关益生特性试验.试验共分离出3株细菌,YB6、YB42和YB56,通过菌落形态观察及16S rRNA序列分析,鉴定结果显示其分别为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis strain)、暹罗芽孢杆菌(Bacillus siamensis strain)和解淀粉酶芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens strain).试验结果表明,3株菌均具有良好的产胞外蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶及抑制病原菌的能力,可以作为促消化和病原拮抗益生菌做进一步的研究.